【4.6.1】预测RNA-RNA相互作用--INTARNA
INTARNA算法通过结合种子约束和交互位点可访问性(seed constraints and interaction site accessibility),能够快速准确地预测 RNA-RNA 结合。
可以用来预测潜在的microRNA结合位点。
参考资料
- IntaRNA 2.0: enhanced and customizable prediction of RNA–RNA interactions。 https://academic.oup.com/nar/article/45/W1/W435/3796327
- https://github.com/BackofenLab/IntaRNA
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