RNA
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一、基本概念
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1.9 人物
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二、RNA药物
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三、实验部分
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3.1 结构
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3.2 翻译
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3.3 分离纯化
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3.4 RNAseq
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3.5 稳定性
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3.8 工艺
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四、RNA结构
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4.0 结构与功能
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4.1 二级与三级结构
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4.2 结构预测
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4.6. 相互作用
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五、密码子优化(mRNA)
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5.1 网页工具
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5.2 原理讨论
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5.3 数据库
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5.4 本地化设计工具
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5.5 其他位点
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六、 RNA编辑
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6.1 gRNA
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八、 其他RNA
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8.1 siRNA
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8.2 microRNA
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8.3 circRNA
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8.4 saRNA
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8.5 其他
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九、mRNA
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9.1 cap
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9.2 IVT
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9.3 polyA
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9.4 ds RNA
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9.5 promoter与terminator
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9.6 UTR
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9.7 stability
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9.8 修饰
总篇数:134
- 2018/08/16 【1.1.1】各种各样的RNA(Versatile RNAs)
- 2022/08/25 【1.1.1.2】小核酸药物
- 2018/08/30 【1.1.2】RNA世界假说
- 2021/11/25 【1.1.4】RNA序列分子式和分子量
- 2018/08/30 【1.1.3】RNA蛋白质复合物
- 2022/01/25 【1.1.5】非编码RNA种类与功能简介
- 2021/02/27 【1.2.1】SD序列
- 2021/11/07 【1.2.2】起始和终止密码子
- 2021/02/28 【1.2.2】Kozak序列
- 2021/03/09 【1.4.1】双链RNA结合基序
- 2021/08/10 【1.5.1】RNA病毒中的非规范翻译(non-canonical translation,IRESes)
- 2022/02/02 【1.9.1】Rhiju Das
- 2022/04/29 【2.1.1.2】自组装mRNA疫苗
- 2021/02/19 【2.1.1.1】基于mRNA的疗法-开发新型药物
- 2021/05/11 【2.3】RNA专利解读(CureVac)
- 2021/10/06 【2.5】mRNA 编码细胞因子
- 2021/07/20 【2.4】LNP-mRNA的非免疫疗法应用
- 2021/07/27 【3.1】核酸结构测定
- 2021/08/07 【3.2.1】翻译组学相关技术的应用研究进展
- 2021/08/08 【3.2.2】通过蔗糖梯度分级(Sucrose Gradient Fractionation)对 mRNA 翻译进行分析
- 2021/10/15 【3.3.1】反相离子对色谱法 Reversed phase ion pair chromatography (RP-IP)
- 2021/10/16 【3.3.2】毛细管电泳CE(Capillary electrophoresis)
- 2022/08/28 【3.4.1】rna-seq
- 2022/08/29 【3.4.2.1】scRNA-seq和空间转录组
- 2022/08/30 【3.4.3.1】新生RNA(nascent RNA)
- 2021/11/13 【3.4.4.1】核糖体图谱分析Ribosome profile(Ribo-seq)
- 2022/12/29 【3.4.5.1】可见分光光度计进行核酸热稳定性测量(Tm)
- 2022/09/01 【3.4.5.1】RNA结构与相互作用分析
- 2022/02/06 【3.8.1】mRNA药物的生产工艺(MOD)
- 2022/05/08 【4.1.1】RNA 结构和功能之间相互作用
- 2018/08/30 【4.1.1】RNA二级结构(ds)
- 2022/12/20 【4.1.2】几种基于核酸序列构建三维结构的工具
- 2022/05/09 【4.0.1】RNA二级结构的全基因组分析
- 2018/08/30 【4.1.2】RNA的三级结构(pseudoknot,kissing loop)
- 2020/01/23 【4.2.1】预测RNA二级结构RNAfold
- 2021/05/06 【4.2.2】预测RNA二级结构RNAstructureWeb
- 2021/03/14 【4.2.3】LinearFold
- 2021/05/08 【4.2.4】RNA二级结构可视化forna
- 2021/08/11 【4.2.5】预测RNA二级结构mfold
- 2022/11/05 【4.2.6】预测RNA二级结构LinearPartition
- 2021/07/28 【4.3.1】来自大型开放实验室的RNA设计规则(EteRNABot、eternagame)
- 2021/07/29 【4.3.2】AntaRNA
- 2022/12/15 【4.6.1】预测microRNA结合位点--miRanda
- 2022/02/03 【4.6.1】预测RNA-RNA相互作用--INTARNA
- 2020/04/08 【5.1】密码子优化
- 2021/05/02 【5.1.2】密码子使用偏性
- 2020/04/09 【5.2.1.1】人体疗法中密码子优化的关键分析
- 2020/11/14 【5.2.1.2】用于设计定制合成基因的计算工具和算法
- 2020/11/23 【5.2.1.3】密码子优化的干扰素γ在CHO细胞中的增强表达
- 2020/11/24 【5.2.1.4】重组生物治疗药物生产中的密码子优化的潜在风险和注意事项
- 2020/11/25 【5.2.1.5】同义密码子选择对合理蛋白质设计的贡献
- 2020/11/26 【5.2.1.6】真核基因组中的近中性和密码子使用偏好的演变
- 2022/05/11 【5.2.1.7】由遗传密码产生的 mRNA 二级结构的周期性模式
- 2022/05/12 【5.2.1.8】人类转录组中 RNA 二级结构的景观和变异
- 2020/04/10 【5.3】密码子使用情况数据库(Codon Usage Database)与CAI
- 2020/11/13 【5.4.1】密码子优化本地化不靠谱的软件
- 2020/04/11 【5.4.2.4】Codon optimization(19年基于二级结构优化密码子的开源工具)
- 2020/11/11 【5.4.2】codonw
- 2020/11/12 【5.4.2.2】jcat
- 2020/11/13 【5.4.2.3】mRNA-optimiser
- 2020/11/15 【5.4.2.5】tAI
- 2020/11/16 【5.4.2.6】cai
- 2023/01/03 【5.3.1.2】密码子和密码子对使用表 ( CoCoPUT )
- 2023/01/02 【5.4.3.1】DNA Chisel,一种多功能序列优化器
- 2020/11/09 【5.5】酶切位点
- 2021/07/25 【5.6.1】基于 RNA 的疗法的 mRNA 结构、稳定性和翻译的组合优化
- 2022/02/01 【5.6.1.2】通过二级结构设计稳定信使RNA的理论基础--superfolder mRNA
- 2022/05/07 【6.1.1】RNA编辑
- 2019/10/19 【6.1.1】CRISPR/Cas简介
- 2019/11/01 【6.1.2】CRISPR-Cas9 gRNA设计工具的比较
- 2019/11/02 【6.1.3】gRNA库
- 2019/10/27 【6.2.1】CHOPCHOP-v1
- 2019/10/28 【6.2.2】CHOPCHOP-v2
- 2019/10/30 【4.2.3】CHOPCHOP-v3
- 2021/04/22 【6.2.4】CHOPCHOP的部署
- 2019/11/28 【6.3】SPROUT
- 2019/11/29 【6.4】DeepCRISPR
- 2019/12/17 【6.5.1】CRISPR-Cas9介导的基因失活的高活性sgrNAs的合理设计
- 2019/12/16 【6.5.2】优化的sgRNA设计可最大化crisPr-cas9的活性并最小化脱靶效应
- 2019/12/18 【6.6】具有工程RNA二级结构的CRISPR系统的特异性增加
- 2020/12/15 【6.7.1】CRISPR脱靶预测经验
- 2020/12/17 【6.7.1】最新开发的策略可最大程度地减少CRISPR-Cas介导的基因组编辑中的脱靶效应
- 2020/10/10 【6.7.1】CRISPR/Cas9介导的基因组工程中的脱靶效应
- 2020/12/16 【6.7.2】Cas-OFFinder预测gRNA的mismatch区域
- 2020/12/17 【6.7.2】Off-Spotter
- 2020/12/18 【6.7.3】Digenome-seq
- 2020/12/19 【6.7.3】GUIDE-Seq
- 2021/05/25 【6.8.2】Sanger测序数据的编辑效率分析 (TIDE)
- 2021/04/26 【8.1】 siRNA 设计原则和药物开发中生物转化和处置
- 2021/10/13 【8.2.1】microRNA
- 2021/04/12 【8.2.2】microRNA组织表达
- 2022/02/08 【8.3.1】RNA的体外环化
- 2022/02/10 【8.3.2.1】优化splint
- 2022/04/21 【8.3.3.1】Clean-PIE
- 2022/02/18 【8.3.4.1】构建环形RNA稳定高效表达蛋白
- 2022/05/15 【8.3.4.2】工程化circRNA
- 2022/09/04 【8.3.4.3】环状RNA的制备
- 2022/09/05 【8.3.5.2】IRES介绍
- 2022/05/16 【8.3.5.3】IRESbase
- 2022/04/03 【8.4.1】saRNA(自我复制RNA)简介
- 2022/05/02 【8.5.1】exoRBase(miRNA/circRNA/lncRNA)
- 2022/05/05 【9.0】原核与真核生物mRNA的特征比较
- 2021/05/01 【9.1.1.1】mRNA cap
- 2021/05/12 【9.1.1.2】哺乳动物细胞功能和命运中的mRNA帽调节
- 2022/02/22 【9.1.1.3】mRNA共转录加帽技术
- 2022/04/16 【9.1.4】酶加帽法
- 2023/01/27 【9.1.5】5-prime capping of mRNA
- 2022/04/13 【9.2.1】IVT(mRNA合成|In Vitro Transcription)
- 2021/03/02 【9.3.1】polyA
- 2021/03/01 【9.3.2】多任务polyA尾巴--核RNA成熟、降解和输出
- 2021/05/19 【9.3.3】mRNA 去腺苷酸化
- 2021/05/15 【9.3.4】mRNA polyA
- 2021/10/20 【9.3.5】聚腺苷酸化信号(PAS,polyA信号,SV40)
- 2021/10/19 【9.3.6】mRNA polyA的测定
- 2022/04/30 【9.3.7】mRNA体外酶连polyA
- 2021/05/16 【9.4.1】dsRNA--了解和克服合成 mRNA 的免疫反应
- 2022/05/14 【9.4.1.2】高温体外转录合成低免疫原性RNA
- 2023/02/15 【9.4.1.3】dsRNA产生的过程
- 2021/05/18 【9.5.2】Run-Off Transcription
- 2021/08/06 【9.5.3】启动子和终止位点预测
- 2021/07/26 【9.6.2】真核 mRNA 的 5'-非翻译区的翻译控制
- 2021/11/15 【9.6.3】UTR库--AURA
- 2021/11/16 【9.6.4】UTR库--UTRdb
- 2021/10/12 【9.6.1.1】mRNA UTR(Untranslated regions)
- 2022/01/30 【9.6.1.2】3UTR
- 2022/01/29 【9.6.1.3】3' UTR 在做什么
- 2021/10/18 【9.7.1】脂质纳米颗粒递送系统中 mRNA 活性丧失的新机制
- 2022/02/16 【9.7.2】酵母细胞质中mRNA降解
- 2022/02/04 【9.7.2】RNA 降解
- 2022/02/14 【9.8.1.1】RNA修饰
- 2023/01/26 【9.8.1.2】体外转录 mRNA 的核苷修饰,以降低免疫原性并改善预防性和治疗性抗原的翻译
- 2022/02/15 【9.8.2.1】m6A
- 2022/04/23 【9.8.2.2】RNA的U修饰(假尿嘧啶)
- 2022/09/08 【9.8.2.2】N1-甲基假尿苷在新冠肺炎疫苗中的作用