bin

一、基本概念
二、拼接
三、聚类/分类
四、分析流程
4.1 metawrap
五、模拟数据

总篇数：22

2015/05/11 【1.0】 scaffold和contig的区别
2015/05/11 【1.1】k-mer基于de Bruijin graphs算法的序列组装
2022/03/29 【1.1.2】jellyfish--kmers统计
2015/05/26 【1.2】TNF四核苷酸多态性-TETRA
2015/05/26 【1.3】平均核苷酸一致性-ANI
2015/05/11 【2.0】基因组组装-拼接的两种算法OLC和DBG
2015/05/11 【2.1】序列拼接-metavelvet
2015/05/11 【2.2】序列拼接-idba-ud
2015/05/11 【2.3】序列拼接-velvet
2020/11/04 【2.4】序列拼接-spades
2015/05/11 【3.0】宏基因组聚类-binning-classification
2015/05/11 【3.1】宏基因组聚类-LMAT
2015/05/11 【3.2】宏基因组聚类-LCA(Lowest Common Ancestor)
2021/01/21 【3.3.1】聚类蛋白质序列(cd-hit,uclust,kclust,usearch,MMSEQ,LINCLUST,LAST)
2021/01/17 【3.3.2】序列聚类（mmseqs2）
2021/01/18 【3.3.3】序列聚类（vsearch）
2021/01/23 【3.3.4】Linclust序列聚类（基于Kmer，更快速）
2014/06/14 【3.3.5】usearch--比对，聚类，去除chimera
2022/02/25 【3.6.1】宏基因组分类注释的工具比较
2020/09/26 【4.1】宏基因组分析--MetaWRAP
2020/10/26 【4.2】宏基因组分析--MetaWRAP分析示例
2021/09/05 【5.1】基因组学和宏基因组学的测序模拟器--MetaSim